近日,湖南农业大学水产学院李德亮教授课题组完成了江蚬的染色体水平基因组构建,研究成果以“Chromosome-level genome assembly of the estuarine Corbicula flumnalis from the Yangtze River estuary in China”为题发表于《Scientific Data》。
本研究采集了栖息于长江口的江蚬样品,结合三代测序和 Hi-C 等方法,成功构建了染色体水平的江蚬基因组,组装得到基因组大小为 1140.30 Mb,共有 25363 个蛋白编码基因,基因组序列锚定到了 19 条伪染色体上。比较江蚬与海洋贝类硬壳蛤 (Mercenaria mercenaria) 的基因组共线性,发现两者的 19 条染色体显示保守的一一对应关系。
湖南农业大学水产学院博士研究生唐杨欣为论文的第一作者,李德亮教授为通讯作者。本研究得到了国家自然科学基金面上项目、国家重点研发计划和湖南省现代农业产业技术体系的支持。